福利天堂已经形成了以省部级重点实验室为平台的重点实验室集群。其中教育部重点实验室有3个：急救与创伤研究教育部重点实验室、热带转化医学教育部重点实验室、生殖健康及相关疾病研究与转化教育部重点实验室；教育部工程研究中心1个：热带药物创新与转化教育部工程研究中心；国家卫生健康委重点实验室1个：国家卫生健康委热带病防治重点实验室。
省级重点实验室7个：海南省热带药用植物研究开发重点实验室、海南省人类生殖与遗传重点实验室、海南省肿瘤发生和干预重点实验室、海南省创伤与灾难救援研究重点实验室、海南省热带脑科学研究与转化重点实验室、海南省热带心血管病研究重点实验室、海南省运动与健康促进重点实验室（社会科学）。
联合实验室2个：海南医科大学－香港大学联合热带病传染重点实验室、建衰老与肿瘤国际研究中心（滨颁础颁）。
科研共享平台2个：海南省药物安全性评价研究中心、福利天堂科学实验中心。
另有省级医学临床研究中心5个、省级国际联合研究中心1个、省级资源库1个、省级工程研究中心8个、海口市重点实验室3个、海南省院士工作站8个、院士创新中心7个、博士后科研工作站4个。
2020—2025年，共获得省部级及以上奖项36项，其中包括海南省自然科学奖一等奖4项、科学技术进步奖一等奖2项、中国发明协会“发明创业奖创新奖”一等奖1项。获批省部级科研项目518项，国家自然科学基金资助382项。以第一作者或通讯作者在国内外学术刊物发表论文近万篇，其中被厂颁滨收录2891篇，中文核心2279篇，在《Cell》《Nature》《Science》《BM）》《THE LANCET Oncology》等顶级刊物上发表高水平SC论文共14篇。近五年，年均到校科研经费5047.73万元，其中年均纵向科研经费4170.69万元。
学校主办6本学术期刊：海南医科大学学报（中文版）、亚太热带医药杂志（英文版） (Asian Pacific Journal of Tropical Medicine）、亚太热带生物医学杂志（英文版）（Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine）、急性病杂志（英文版）（Journal of Acute Disease）、亚太生殖杂志（英文版）（Asian Pacific Journal of Reproduction）、同一健康通报（英文版）（One Health Bulletin）。
第五轮省级特色重点学科评审中，我校共7个学科入围，即础类1个（临床医学），叠类6个（中医学、公共卫生与预防医学、药学、护理学、基础医学、特种医学）。
全球领先的高等教育评价机构软科发布“2025软科世界大学学术排名”，我校首次上榜。临床医学进入贰厂滨学科排名前5‰，药理学与毒理学、生物学与生物化学进入前1%。现有5个博士学位授权点、15个硕士学位授权点，硕博士学位点涵盖医学、理学、管理学、工学、交叉学科等5个学科门类。
叁家附属医院围绕“大病不出岛”目标，不断提升医疗技术应用能力，针对性补齐学科技术短板，共拥有22个国家临床重点专科，27个省级临床医学中心，基本实现专业病种全覆盖。
